鉴别要点：一是传播速度不同，传染性支气管炎传播迅速，短期内可波及全群，发病率高达90％以上。新城疫因大多数接种了疫苗，临床表现多为亚急性新城疫，发病率不高。二是新城疫病鸡除呼吸道症状外，还表现歪头、扭颈、站立不稳等神经症状，传染性支气管炎病鸡无神经症状。三是剖检病变不同，新城疫病鸡腺胃乳头出血或出血不明显，盲肠扁桃体肿胀、出血，而传染性支气管炎病鸡无消化道病变，肾型传支病例可见肾脏和输尿管的尿酸盐沉积，腺图形传支病例可见腺胃肿大。
与禽流感的鉴别诊断高致病性禽流感病鸡表现的呼吸道症状与传染性支气管炎相似。鉴别要点：一是传染性支气管炎仅发生于鸡，各种年龄的鸡均有易感性，但锥鸡发病最为严重，死亡率最高，而禽流感的发生没有日龄上的差异。
二是传染性支气管炎病鸡剖检仅表现鼻腔、鼻窦、气管和支气管的卡他性炎症，有浆液性或干踏样渗出，肾型传支病鸡的肾脏多有尿酸盐沉积，其余脏器的病变较少见，而禽流感表现喉头、气管环的充血或出血，肾脏多肿胀充血或出血，仅输尿管有少量尿酸盐沉积，且其他脏器也有变化，如腺胃乳头肿胀、出血等。
与传染性喉气管炎的鉴别诊断传染性喉气管炎病鸡表现的呼吸道症状与传染性支气管炎相似，且传播速度也很快。鉴别要点：一是发病日龄不同，传染性喉气管炎主要见于成年鸡，而传染性支气管炎以10日龄～6周龄的锥鸡最为严重。二是成年鸡发病时二者均可见产蛋量下降，且软蛋、畸形蛋、粗壳蛋明显增多，传染性支气管炎病鸡产的蛋质量更差，蛋白稀薄如水，蛋*和蛋白分离等。